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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力外来物种特异形、寡核苷酸修饰语投资成本比较高或操作的程序有难度。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯老师管理团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低代价、跨植物物种、全电商平台兼容的全新解决方案。

期刊杂志概况

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的完美研究分析有效院显性基因与成长发育生物体工程制品学研究分析方案所和我国的显性基因學會主办单位的国际级科研杂志,坚持创新驱动于新闻稿我的生命完美研究分析研究分析有效和医学专业显性基因学各个行业业务领域的原創性研究分析方案技术成果。JGG 202四年度影响力指数7.1,Scopus科研杂志评判评价指标CiteScore 9.9,排名第JCR 202四年度GENETICS & HEREDITY各个行业业务领域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY各个行业业务领域Q1区,排名第我国的完美研究分析有效院杂志设计布局生物体工程制品学个类别1区(Top杂志),显性基因学和生物体化与分子结构生物体工程制品学小类双1区。

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哪些是HEATag

比较巧妙的“二一体化”设定

HEATag是由凝集素和HUH内切酶搭建的融成蛋白酶

「定位手机器」传感器 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化绘制(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接器」板块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数条型码来共价联系。

“1+1>2”的效果好:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品图标与朔源。

Fig1: HEATag多种标出设计原理展示图

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操作测试

HEATag到低有点能打?

会在不同的能力下,实行喂乳宠物体肿瘤细胞系单体肿瘤细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。分析团队图片为 HEATag 设计了多轮 “负荷测试方法”,从神经元系到神经元核,从常温下到底温,从新鲜范本到确定范本,全位置校验它的固界定和稳定可靠性分析。

一场测试测试真对辅乳期食草动物血内部系:学习工作人员采用了是来自于人、鼠、仓鼠这几个植物植物种类的每种血内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在制冷使用 HEATag 符号后比调测序。进而环保再生资源回收的 11447 个血内部中,85.66% 都能确认 HEATag 条型码精确性自动匹配到原植物植物种类,样版间交叉点水污染极低,UMAP 聚类浅析浅析体现了一直证明格式,HEATag 条型码与植物植物种类特异形什么是基因组有特点的高度完全一致。 之后,软件测试必要必要条件进一歩在线升级:的研究人数试试在 4℃下标上新鲜毛肚感组织、在室内温度下标上甲醇调整组织,甚至是直观标上组织核。結果依旧优异:那些必要必要条件下,范例标价签与外来物种问题均具备很好的的相关联性,分拆为准率超 95%。殊不知甲醇调整会会造成略微的转录本交叉性感染,组织核化学合成会少许 RNA 掉失,组织型的注脚結果依旧与新鲜毛肚感范例增加一样,表明 HEATag 是可以标上不相同治理必要必要条件下的检测范例。

Fig2: HEATag 可在有差异标准下成功完成单细胞膜转录组混样讲解

可以标上哺乳期间哺乳动物界和海域无脊梁骨哺乳动物界的原代人体细胞

如若说細胞系测评是 “核心题”,那组织结构模板即使 “增加题”, 以下模板一般因細胞业务类型复杂的、的环境适于性比较特殊,作为标记符号技能的 “突破点”,而 HEATag 恰恰恰在以下 “突破点” 上创造了优缺点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸安排,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞一方面能被准确无误判别,所有主要的上皮细胞的类型的聚类分析法报告单都明了可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浅海生物学的匹配性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与植物物种转录组拥有较高统一性,没得突然出现因高盐环镜会造成的 “标识损坏”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可进行喂奶动植物组织结构模板很多 scRNA-seq 分析一下

Fig4: HEATag可构建新鮮海洋环境无脊柱植物多种 scRNA-seq 介绍

HEATag与癌细胞的融入不可能受到转录组的偏态改动

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在到位图标目标的时,会对后期的转录混合物析引发侵扰,切实保障了探析资料的真性。

Fig5: HEATag不太会印象范本的 RNA 表述模式切换

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前景可期

HEATag 能为单人体细胞探讨引来啥?

HEATag 的价值观,远不停于 “解決标上方面”,它的灵巧性和普遍意义,未能为单神经元实验打開更大几率性

从利用的场景一起来看

HEATag 能遮盖从 “轻松相对比较解析”(如癌组建机构与很正常组建机构、用量解决与相较比较)到 “大投资额调查”(如组建机构生殖内部图谱绘图、高通骁龙量选择)的全面积的需求。跟随着 PIP-seq、Stereo-cell 等最新型可加密高技术的发展壮大,HEATag 还能进一点提高单生殖内部调查的通量,帮助科技创业团队进行挺大投资额的内容。

从跨前沿技术有潜力来瞧

HEATag 不只适用性于转录组学,还能与表观人类基因组学、球蛋白质含量组学、空間组学等枝术结合在一起,实现制作指数和寡核苷酸字段,HEATag 会简单容入有所不同的组学方法,不后果无线信号猎取高度。的同时,因为HEATag还会快速发展单細胞糖组学研究探讨枝术。

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进行合作动图

拜谱生物学与陈凯传授实现目标大概配合意想

值得购买私信的是,在 HEATag 技術凸显出不小软件优势的视频背景下,拜谱海洋生物工程技術已与中国南方海洋环境海洋生物工程有效与建设工程广东省科学化学科学实验室建设中的安防系统(佛山)陈凯专家获得分式的运算加盟意想。夫妻双方计划怎么写把握 HEATag 技術的流通业化半空、研发转换成等方向盘拉开厚度操作,引领这种成本分析价、跨外来物种的单人体細胞标出技術较快软件于实计研发景象,为更高科学化学科学实验室建设中的安防系统提高高效率的、经济社会的单人体細胞论述生产工具,肋力研发运转者在人体細胞海洋生物工程技術学、海洋环境海洋生物工程海洋生物工程技術学、消化道疾病体系等方向授予更高冲破
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