
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达核蛋白组学产品,实现1000+什么难以理解的度修饰语位点验出,稳定的重演經典靶点,全多方面生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“查证”全具体流程服务质量,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验所程序流程
02、亲测数据源
03、经“点”重新
在实际数据统计中,查出2个文章中了解的經典靶点及及其衣康酸突显位点,如第某个个被察觉的衣康酸共价突显球蛋清酶KEAP1,还是有糖酵解径路中的3个重要的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及及炎性小体形成球蛋清酶NLRP3和细胞核萎缩方式中的重要的球蛋清酶RIPK3等,其质谱图给出图提示。
04、成品性能
1.几吨质控
商业性化特情人电极孵育、SDS-PAGE在线测试、WB印证、范本关于性讲解等相互位在线测试,切实保障投资项目最终信得过性。2.高安全性能质谱测量仪器app平台
在Orbitrap Astral全新几代高粪便质谱仪加持咒下,构建衣康碱化表达位点及血清判定新淬硬层,肋力专业理论研究新感觉。3.全程序流程一走式服务项目
通过拜谱生物制品建立健全的调查手机平台,可具备“体细胞训练→在线检测工具器孵育→WB在线检测工具→高妙度衣康硝化作用修饰语在线检测工具→特权生信分折→指定区域位点PRM核验”全步骤产品,省时省劲、方便更皮实。05、介绍玩法(一些)
06、使用方向上
PART 2、论文资料分享图片
文献资料一
英语翻译子标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译题头:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探索内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
资料二
日语副标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
简体中文关键词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究探讨介绍:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、 装修案例双重性理念
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13拥有较为强烈的底物综合能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物学衣康酸性反应装饰组监测的数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化体现(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
身为TCA无限循环中的中心细胞消化吸收物,衣康酸可以调节细胞消化吸收、抗体和病症两者的能够 意义,为改善抗体病症性病症能展示了带替改善营销策略。衣康酸构成中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸构成能对血清质上的可溶性半胱氨酸残基使用烷基化淡化(迈克尔加上反响),这类汉语翻译后淡化被称是“衣康酸淡化(itaconation)”,从根本上后果血清质基本功能,国家宏观调控抗体回应和细胞消化吸收行业,为多病症药材研制开发能展示新工作思路。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸修饰语蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学绝定量分析靶点代谢率组(QMT1000)或势能分解分解靶向疗法分解分解组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
符合文章
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.