草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿控制系统化最经一般的急病之四。肾进行中CaOx多晶体过过饱和沉淀会造成肾小管细胞核破损和凋亡，可以造成肾结石的建立。短链乳酸酸由消化道内好氧池病菌堆肥膳食结构钎维引起，这样不仅在布局消化道防御控制系统中切实展现目的，但是在控制系统化含量上也切实展现根本目的。在这当中，丁酸是最非常丰富的短链乳酸酸，更具抗感染和免役可以抑制目的,本研发研究丁酸对CaOx肾结石的目的基本因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿产科吴忠讲解、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健教授在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网洛药学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容公司名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业行业：华山医生 研究探讨物体：大鼠、HK-2癌细胞 分类新信息：参考组（Con）、模特组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来技木：数据网络临床药理学验测

思维工作流程表

科学研究报告单

调查考生一开始构造 大鼠建模方法，借助顺利什么是生化质量指标和企业病理报告学刺绣等调查的方法看到丁酸需要可以减少CaOx建模方法大鼠肾CaOx结晶体的变成和神经损坏，改进CaOx建模方法大鼠的支原体感染神经损坏和被氧化反应有害物质的过渡展现。除此以外，丁酸还可调控草酸引发的HK-2内部神经损坏、被氧化反应应激反应和内部凋亡。 为与探讨丁酸型式和靶染色体的统计数据解析在线，研究解析员工从PubChem得到丁酸和丁酸酯的二维和三维空间型式（图1A）。依据PharmMapper的统计数据解析库和Uniprot的统计数据解析库治疗后共筛分出1115个丁酸靶染色体供进一歩解析。将染色体汇总把手机通讯录STRING的统计数据解析库，参与者PPI的统计数据解析在线解析。Cytoscape明确了排列的前20的核心区靶染色体的详实的统计数据解析在线图，也包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。某些核心区染色体与的统计数据解析在线中的另一染色体均展现出一些的相关的性剖析，原因剖析某些染色体机会引领着信息化效果。GO和KEGG解析论述了丁酸核心区染色体的相关的行业和生态学学用途（图1C）。核心区染色体最注重与类固醇雄雄激素回应、阳极脱色应激状态状态回应、灵灵活性氧人体细胞对类固醇雄雄激素刺激能力的表现及对酸碱性化学工业的物质的表现想关。综上所诉所诉，某些核心区染色体最注重参与者了阳极脱色应激状态状态和对灵灵活性氧的生态学表现的过程 ，是肾结石进行体系中至关注重的行业，这表示丁酸机会在肾结石中引领注重效果。

图1| 丁酸构造与靶dna微信网络研究(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步宇宙探索丁酸对CaOx肾结石真是切靶dna，实验工人应用GEO的服务器对GSE73680中绿色健康比对与CaOx肾结石病患的dna差别开展了实验。比对组与CaOx结石病患的有明显能力差别传达dna（DEGs）产前筛查标准单位为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个dna发现有明显转变，至少3379个（89.4%）dna传达上涨，404个（10.6%）dna传达变动（图2A）。对DEGs开展聚类分析法分析一下分析一下，热图提示了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析法分析一下基本特征（图2B）。陆陆续续，实验工人开始GeneCards的服务器手动鉴定结论了370个机会与CaOx肾结石有关的的dna，关键性词排名前20位的估计dna还有有关的性评分系统就像文中2C图甲中。为了更好地找寻丁酸治疗方法CaOx肾结石的关键性靶点，实验工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的dna处置得到了一个Venn图。最中，CYP2C9被设定为丁酸后果CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。不但，实验工人还开展了丁酸与CYP2C9的分子式对接的，CYP2C9的二个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸能够 功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在使用互联网药理学学预侧CYP2C9是丁酸作用CaOx肾结石的靶基因遗传后，探索人工还借助人体组织细胞科学试验确认了CYP2C9可降底草酸成脂的HK-2人体组织细胞的ROS级别、疾病板材损害和凋亡。

图2| 许多据库联和数据分析预测分析CYP2C9是丁酸使用于CaOx肾结石的靶基因遗传

论述最终

本科研前提找到丁酸在休外和身体里均能减弱CaOx肾结石模板的阳极防氧化应激反应状态和感染病变受损，随后不久采用网洛药学学淘汰能够得到丁酸影响到CaOx肾结石的内在的靶点——CYP2C9，还有采用受损受损细胞实验设计验证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2受损受损细胞ROS层次、感染病变受损和凋亡。等找到呈现丁酸有机会采用减弱CYP2C9来减弱CaOx肾结石的阳极防氧化应激反应状态，减少感染病变受损。这一项流程中拜谱微微生物打造了网洛药学学新能力软件，然而拜谱微微生物可增加熟进一步优化的人类基因组学、核胆固醇组学、排泄组学等两组学软件及新能力软件，欢迎词详询资讯！ 参考选取论文资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.