
近日,杭州医科专科大学一附设医生王学浩科学院院士管理团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向药物能源产生检测分析服务。
英文字母主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
的客户标准:南京医科大学
调查相关材料:细胞
拜谱提高服务保障:转录组测序+血清互作组+靶向治疗能源分解组
技术工艺路线图:
设计报告单
01、YBX1被判定为HCC中糖酵解的重要DNA
本论述录入HCC癌症样版(n=7)的单受损淋巴良性肿瘤細胞RNA测序数据报告研究探讨集去研究探讨,察觉到糖酵解活力性核心聚焦在癌症受损淋巴良性肿瘤細胞中,hdWGCNA研究探讨掌握出9个染色体控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的能研究探讨确立YBX1为经济独立能投资风险客观因素(图1H)。进一大步搭配IHC、WB实践和癌症组识结构与最靠近非癌症组识结构的余地转录组学数据报告研究探讨集查证YBX1是肝受损淋巴良性肿瘤細胞癌制疗的内在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为自动调节HCC细胞系糖酵解的要点要素
02、YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物电能消化吸收组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1根据并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1构建并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化不断增强其磷过酸,然后有利于促进其核转位
进三步的检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是后果其磷过酸,在OGT敲低的HCC组织体细胞中或用OGT控药物OSMI-1解决,YBX1淀粉酶质量相关系数消减,YBX1磷过酸相关系数变少(图4A-C)。IP测试提示 ,在相当的Flag-YBX1底物质量下,YBX1-WT的磷过酸质量相关系数远远超出YBX1-T57A,说明磷过酸的不断增加既仅是所以更快的YBX1淀粉酶表述(图4D)。脱离了核和质类物质知道TMG解决的HCC组织体细胞中YBX1核表述的提升(图4E-F),进三步知道YBX1磷过酸的根本上下调整细胞是AKT(图4G-I)。这么多知道特别指出O-GlcNAc糖基化依据催进其磷过酸来激发YBX1淀粉酶稳固性并催进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰不善于其进一大步遭受磷碱化装饰并也可以有利于其核转位
05、YBX1加速PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加快PKM2转录
06、YBX1 才可以提高自己组核蛋白乳硝化作用呈现级别
钻研看见YBX1敲低更为明显拉低淀粉酶质乳过酸,越发是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解仰制作用剂2-DG的实验所可确认了糖酵解与组淀粉酶乳过酸的可以的连接,仰制作用糖酵解可更为明显拉低H3K18la关卡(图6D)。PKM2过呈现出可逆性转YBX1敲低造成的的H3K18la越来越低,以外源乳酸操作除了加快H3K18la,还随之YBX1呈现出调涨,提示卡现实存在双向反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la能够丰度于YBX1重新启动子可以的带动其转录,该时受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并看见P300 调涨是YBX1资料H3K18乳酰化为用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1资料H3K18乳碱化绘制水准
文章标题工作小结
在这个的研究中媒体报道了YBX1在HCC中高传达,且与糖酵解密码切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,而使相对稳定血清质含量质并添加其传达。一种淡化还提高网站YBX1在T57处的磷碱化,提高网站其核易位。由于,这种流程增强学习了糖酵解有关什么是基因遗传的转录并伤害性乳酸的引发。不仅,YBX1缴活P300的转录,转而驱动器组血清质含量的乳碱化,很是H3K18la,H3K18乳碱化正在向调空YBX1什么是基因遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传正反面馈环考核机制图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗能力代谢转化组技术服务,拜谱生物制品建立了完善成熟的转录组学、血清组学、译文资料后体现组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
学习医学文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.