
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发结果显示
科学研究工作员研究近年来冷库箱时段不断延长牛羊肉的对抗强度、持混流式水轮机、色度、分散于铁量、ROS、脂质过阳极铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4情况来分析评估健身肌肉安排组织的铁消失形态。然而出现,冷库箱时段不断延长后,牛羊肉的对抗强度在第四天和第6天特殊越来越低;持水作用拉低;色调变深,丢掉光泽感,鲜色变的暗色。另外,分散于铁、活性氧氧和MDA的量特殊延长,组织凋亡率特殊增高。 探究人转化成有异同 速冻时刻的相关肌肉组织打样定制的高核血清酶质,接着开展SDS-PAGE定性数据分析,高核血清酶质条带在有异同 南北朝时期规划透亮且类似的(图1a)。按照高核血清酶在有异同 打样定制中的表达出来现象,定性数据分析表明同样组打样定制的中数字相仿于同样程度(图1b),说明书怎么写相关肌肉组织打样定制高核血清酶质含有不错的组内类似的性和组间异同性。 蛋清酶质组学共监定出1996种蛋清酶质。以B0为对比组,选择B1、B2、B4和B6中的蛋清酶采取之间的关系表示探讨,共监定到375个DEPs。将火山图可视化分享,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05多个标准的探讨DEP。结论如图已知1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别监定出22、33、73和140个DEPs,中仅别上涨6、11、32和89个,下跌16、22、41和5两个。聚类分析方式 评诂了区别冷冻箱过程力量团体中蛋清酶质的表示,结论界面显示力量蛋清酶表示之间的关系随着用时推移储放用时的加入而加入(图1g)。
图1| 其他速冻期限的背部肌肉供试品淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种冷冻箱周期的健身肌肉样板相互影响核蛋白定性分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消失淀粉酶肽的PRM定量定量分析定量分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG聚集一定的差异表示蛋白质的铁突然死亡新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT按量淀粉酶酶质组学方法售后贴心服务,拜谱菌物已研究开发提交并确立了成长成长的转录组学、淀粉酶酶组学、代谢率组学以其多个学结合产品设备方法售后贴心服务指标体系,欢迎致电咨询!
参阅专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.